Airm Nua le haghaidh Fáthmheasa Eitinne agus Braite Frithsheasmhachta i nDrugaí: Seicheamhú Spriocdhírithe Giniúint Nua (tNGS) In éineacht le Meaisín-Fhoghlaim le haghaidh Diagnóis Hipiríogaireachta Eitinn
Tuarascáil litríochta: CCa: múnla diagnóiseach bunaithe ar tNGS agus foghlaim meaisín, atá oiriúnach do dhaoine a bhfuil eitinn níos lú baictéarach agus meiningíteas eitinn orthu.
Teideal an tráchtais: Seicheamhú agus foghlaim mheaisín den chéad ghlúin eile atá dírithe ar eitinn: straitéis dhiagnóiseach ultra-íogair le haghaidh feadáin scamhógacha gann agus meiningíteas feadánacha.
Tréimhsiúil: 《Clinica Chimica Acta》
MÁ: 6.5
Dáta foilsithe: Eanáir 2024
In éineacht le hOllscoil Acadamh Eolaíochtaí na Síne agus Ospidéal Chest Beijing de chuid Ollscoil Leighis Caipitil, bhunaigh Macra & Micri-Tástáil samhail diagnóis eitinn bunaithe ar an ghlúin nua de theicneolaíocht seicheamhaithe spriocdhírithe (tNGS) agus modh foghlama meaisín, a sholáthair ultra-ard. íogaireacht bhrath le haghaidh eitinn le cúpla baictéir agus meiningíteas eitinn, ar fáil modh diagnóis hipiríogaireacht nua chun diagnóis chliniciúil de dhá chineál eitinn, agus chabhraigh an diagnóis cruinn, a bhrath friotaíocht drugaí agus cóireáil eitinn.Ag an am céanna, aimsítear gur féidir plasma cfDNA an othair a úsáid mar chineál samplach oiriúnach le haghaidh sampláil chliniciúil i diagnóis TBM.
Sa staidéar seo, úsáideadh 227 sampla plasma agus samplaí sreabhán cerebrospinal chun dhá chohórt cliniciúla a bhunú, inar úsáideadh na samplaí cohórt diagnóiseacha saotharlainne chun an tsamhail meaisínfhoghlama de dhiagnóis eitinn a bhunú, agus úsáideadh na samplaí cohórt diagnóiseacha cliniciúla chun an chohórt bunaithe a fhíorú. múnla diagnóiseach.Díríodh ar na samplaí go léir ar dtús le linn taiscéalaithe gabhála saindeartha saindeartha do Mycobacterium tuberculosis.Ansin, bunaithe ar shonraí seicheamhaithe TB-tNGS, úsáidtear an tsamhail crann cinnteoireachta chun tras-bhailíochtú 5 huaire a dhéanamh ar thacair oiliúna agus bhailíochtaithe na scuaine diagnóiseacha saotharlainne, agus faightear tairseacha diagnóiseacha samplaí plasma agus samplaí sreabhán cerebrospinal.Cuirtear an tairseach faighte in dhá thacar tástála de scuaine diagnóis chliniciúil lena bhrath, agus déantar feidhmíocht dhiagnóiseach an fhoghlaimeora a mheas de réir cuar ROC.Ar deireadh, fuarthas an tsamhail diagnóis eitinn.
Fíor 1 léaráid scéimreach de dhearadh taighde
Torthaí: De réir tairseacha sonracha sampla DNA CSF (AUC = 0.974) agus sampla plasma cfDNA (AUC = 0.908) a chinntear sa staidéar seo, i measc 227 sampla, bhí íogaireacht sampla CSF 97.01%, ba é an sainiúlacht ná 95.65%, agus ba é íogaireacht agus sainiúlacht an tsampla plasma ná 82.61% agus 86.36%.San anailís ar 44 sampla péireáilte de plasma cfDNA agus DNA sreabhach cerebrospinal ó othair TBM, tá comhsheasmhacht ard de 90.91% (40/44) ag straitéis dhiagnóiseach an staidéir seo i plasma cfDNA agus DNA sreabhach cerebrospinal, agus is é an íogaireacht 95.45% (42/44).I leanaí a bhfuil eitinn scamhógach orthu, tá straitéis dhiagnóiseach an staidéir seo níos íogaire do shamplaí plasma ná torthaí braite Xpert de shamplaí sú gastric ó na hothair chéanna (28.57% VS 15.38%).
Fíor 2 Feidhmíocht anailíse ar mhúnla diagnóis eitinn do shamplaí daonra
Fíor 3 Torthaí diagnóiseacha ar shamplaí péireáilte
Conclúid: Bunaíodh modh diagnóiseach hypersensitive le haghaidh eitinn sa staidéar seo, a fhéadfaidh uirlis dhiagnóiseach a sholáthar leis an íogaireacht braite is airde d'othair chliniciúla a bhfuil eitinn oligobacillary (cultúr diúltach) acu.D’fhéadfadh sé go mbeadh braite eitinn hypersensitive bunaithe ar plasma cfDNA ina chineál samplach oiriúnach chun eitinn ghníomhach agus meiningíteas eitinn a dhiagnóiseadh (tá samplaí plasma níos éasca a bhailiú ná sreabhach cerebrospinal d’othair a bhfuil amhras orthu go bhfuil eitinn inchinne).
Nasc bunaidh: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?trí% 3Dihub
Réamhrá gearr ar tháirgí braite sraithe eitinn Macra & Micri-Tástáil
I bhfianaise staid shamplach casta othar eitinn agus riachtanais éagsúla, soláthraíonn Macro & Micro-Test sraith iomlán de réitigh NGS le haghaidh eastóscadh leachtaithe ó shamplaí sputum, tógáil agus seicheamhú leabharlann Qualcomm, agus anailís sonraí.Clúdaíonn na táirgí diagnóis tapa na n-othar eitinn, friotaíocht drugaí a bhrath eitinn, clóscríobh eitinn mycobacterium agus NTM, diagnóis hypersensitivity eitinn baictéir-diúltach agus daoine eitinn, etc.
Trealamh braite sraitheach le haghaidh eitinn agus mycobacteria:
| Mír Uimh | Ainm Táirge | ábhar tástála táirge | cineál samplach | samhail infheidhme |
| HWTS-3012 | Gníomhaire scaoileadh samplach | Úsáidte i gcóireáil leachtú samplaí sputum, tá uimhir taifead den chéad scoth, Sutong Machinery Equipment 20230047. | sputum | |
| HWTS-NGS-P00021 | Trealamh braite cainníochta Qualcomm le haghaidh eitinn hipiríogair (modh gabhála taiscéalaithe) | Brath hipiríogaireacht neamh-ionrach (bithóipse leachta) le haghaidh eitinn scamhógach baictéir-diúltacha agus nodules inchinn;Rinneadh anailís ar na samplaí de dhaoine a bhfuil amhras orthu a bheith ionfhabhtaithe le eitinn nó mycobacteria neamh-eitinn trí mheitigenomics seicheamhaithe ard-doimhneacht, agus an fhaisnéis braite cibé an raibh eitinn nó neamh-eitinn mycobacteria ionfhabhtaithe agus an phríomhfhaisnéis friotaíochta drugaí céadlíne de mycobacterium tuberculosis. ar fáil. | Fuil imeallach, sreabhach lavage alveolar, hidrothorax agus ascites, sampla puncture fócas, sreabhach cerebrospinal. | An dara glúin |
| HWTS-NGS-T001 | Clóscríobh mycobacterium agus trealamh braite friotaíochta drugaí (modh seicheamhaithe aimpliúcháin ilphléacs) | Tástáil clóscríofa mycobacterium, lena n-áirítear MTBC agus 187 NTM；Clúdaíonn braiteadh frithsheasmhachta in aghaidh drugaí d’eitinn Mycobacterium 13 dhruga agus 16 shuíomh croí-shóchán de ghéinte friotaíochta drugaí. | Sputum, sreabhach lavage alveolar, hydrothorax agus ascites, sampla puncture fócas, sreabhach cerebrospinal. | Ardán déach dara/tríú glúin |
Buaicphointí: HWTS-NGS-T001 Clóscríobh mycobacterium agus trealamh braite friotaíochta drugaí (modh aimplithe ilphléacs)
Réamhrá táirge
Tá an táirge bunaithe ar na príomhdhrugaí céadlíne agus dara líne a thuairiscítear i dtreoirlínte cóireála TB WHO, macrolides agus aminoglycosides a úsáidtear go coitianta i dtreoirlínte cóireála NTM, agus clúdaíonn na suíomhanna frithsheasmhachta drugaí gach grúpa amháin de shuímh a bhaineann le friotaíocht drugaí sa Catalóg de shóchán coimpléascach eitinn WHO Mycobacterium, chomh maith le géinte frithsheasmhachta in aghaidh drugaí tuairiscithe agus suíomhanna sócháin de réir imscrúdaithe agus staitisticí litríochta ardscórála sa bhaile agus thar lear.
Tá sainaithint clóscríofa bunaithe ar na tréithchineálacha NTM a bhfuil achoimre orthu i dtreoirlínte NTM arna bhfoilsiú ag Chinese Journal of Eitinn agus Galair Riospráide agus ar chomhdhearcadh na saineolaithe.Is féidir leis na primers clóscríofa deartha níos mó ná 190 speiceas NTM a mhéadú, a sheicheamhú agus a anótáil.
Trí theicneolaíocht aimpliúcháin PCR ilphléacs spriocdhírithe, méadaíodh na géinte géinitíopála agus na géinte atá frithsheasmhach in aghaidh drugaí Mycobacterium ag ilphléacs PCR, agus fuarthas an teaglaim amplicon de spriocghéin a bhí le brath.Is féidir na táirgí aimplithe a thógáil isteach i leabharlanna seicheamhaithe ard-tréchuir dara glúin nó tríú glúin, agus is féidir gach ardán seicheamhaithe dara glúin agus tríú glúin a chur faoi sheicheamhú ard-doimhneacht chun faisnéis seicheamh na spriocghéine a fháil.Trí chomparáid a dhéanamh leis na sócháin aitheanta atá sa bhunachar sonraí tagartha ionsuite (lena n-áirítear catalóg sóchán coimpléascach eitinn WHO Mycobacterium agus a ghaol le frithsheasmhacht in aghaidh drugaí), socraíodh na sócháin a bhain le frithsheasmhacht in aghaidh drugaí nó so-ghabhálacht drugaí frith-eitinn.In éineacht leis an réiteach cóireála sampla sputum féin-oscailte de Macra & Micrimhilseogra, réitíodh an fhadhb a bhaineann le héifeachtúlacht aimplithe íseal aigéid núicléigh ar shamplaí sputum cliniciúla (deich n-uaire níos airde ná modhanna traidisiúnta), ionas gur féidir seicheamhú braite friotaíochta drugaí a bhrath. i bhfeidhm go díreach ar shamplaí sputum cliniciúla.
Raon braite táirge
34géinte a bhaineann le friotaíocht drugaí de18drugaí frith-eitinn agus6Braitheadh drugaí NTM, ag clúdach297suíomhanna frithsheasmhachta in aghaidh drugaí;Deich cineálacha eitinn Mycobacterium agus níos mó ná190braitheadh cineálacha NTM.
Tábla 1: Faisnéis faoi Dhrugaí 18+6 +190+NTM
Buntáiste táirge
Inoiriúnaitheacht chliniciúil láidir: is féidir na samplaí sputum a bhrath go díreach le gníomhaire féin-leachtaithe gan cultúr.
Tá an oibríocht turgnamhach simplí: tá an chéad bhabhta d'oibríocht aimpliúcháin simplí, agus críochnaítear tógáil na leabharlainne i 3 uair an chloig, rud a fheabhsaíonn an éifeachtúlacht oibre.
Clóscríobh cuimsitheach agus friotaíocht drugaí: clúdaíonn sé suíomhanna clóscríofa agus friotaíochta drugaí MTB agus NTM, arb iad na príomhphointí imní cliniciúla iad, clóscríobh cruinn agus braiteadh friotaíochta drugaí, tacú le bogearraí anailíse neamhspleácha, agus tuarascálacha anailíse a ghiniúint le cliceáil amháin.
Comhoiriúnacht: comhoiriúnacht táirge, oiriúnú d'ardáin phríomhshrutha ILM agus MGI/ONT.
Sonraíocht táirge
| Cód Táirge | Ainm Táirge | Ardán braite | sonraíochtaí |
| HWTS-NGS-T001 | Clóscríobh mycobacterium agus trealamh braite friotaíochta drugaí (modh aimplithe ilphléacs) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Am postála: Jan-23-2024