Arm Nua le haghaidh Diagnóis Eitinn agus Brath Friotaíochta Drugaí: Seicheamhú Spriocdhírithe Glúin Nua (tNGS) in éineacht le Foghlaim Meaisín le haghaidh Diagnóis Hipiríogaireachta Eitinn
Tuarascáil litríochta: CCa: samhail dhiagnóiseach bunaithe ar tNGS agus ar fhoghlaim meaisín, atá oiriúnach do dhaoine a bhfuil eitinn baictéarach agus meiningíteas eitinn níos lú orthu.
Teideal na tráchtas: Seicheamhú den chéad ghlúin eile atá dírithe ar eitinn agus foghlaim meaisín: straitéis dhiagnóiseach thar a bheith íogair do fheadáin scamhógacha gann agus do mheiningíteas feadánach.
Tréimhsiúil: 《Clinica Chimica Acta》
MÁ: 6.5
Dáta foilsithe: Eanáir 2024
I gcomhar le hOllscoil Acadamh Eolaíochtaí na Síne agus Ospidéal Cófra Béising in Ollscoil Leighis Caipitil, bhunaigh Macro & Micro-Test samhail diagnóis eitinn bunaithe ar an nglúin nua de theicneolaíocht seicheamhaithe spriocdhírithe (tNGS) agus modh foghlama meaisín, a sholáthair íogaireacht bhrath thar a bheith ard d'eitinn le beagán baictéar agus meiningíteas eitinn, a sholáthair modh nua diagnóis hipiríogaireachta chun dhá chineál eitinn a dhiagnóiseadh go cliniciúil, agus a chuidigh le diagnóis chruinn, braiteadh friotaíochta drugaí agus cóireáil eitinn. Ag an am céanna, fuarthas amach gur féidir cfDNA plasma an othair a úsáid mar chineál samplach oiriúnach le haghaidh samplála cliniciúla i ndiagnóis eitinn eitinn.
Sa staidéar seo, úsáideadh 227 sampla plasma agus samplaí sreabhán cheirbreosdromlaigh chun dhá chohórt chliniciúil a bhunú, inar úsáideadh na samplaí cohórt diagnóiseacha saotharlainne chun an tsamhail foghlama meaisín de dhiagnóis eitinn a bhunú, agus úsáideadh na samplaí cohórt diagnóiseacha cliniciúla chun an tsamhail dhiagnóiseach bunaithe a fhíorú. Díríodh ar na samplaí uile ar dtús le linn tóireadóirí gabhála spriocdhírithe atá deartha go speisialta le haghaidh Mycobacterium tuberculosis. Ansin, bunaithe ar shonraí seicheamhaithe TB-tNGS, úsáidtear an tsamhail crann cinnidh chun tras-bhailíochtú 5-huaire a dhéanamh ar na tacair oiliúna agus bailíochtaithe den scuaine diagnóiseach saotharlainne, agus faightear tairseacha diagnóiseacha na samplaí plasma agus na samplaí sreabhán cheirbreosdromlaigh. Tugtar an tairseach a fhaightear i dhá shraith tástála den scuaine diagnóiseach cliniciúil le haghaidh braite, agus déantar feidhmíocht dhiagnóiseach an fhoghlaimeora a mheasúnú trí chuar ROC. Ar deireadh, fuarthas an tsamhail diagnóiseach d'eitinn.
Fíor 1 léaráid sceimiteach de dhearadh taighde
Torthaí: De réir na dtairseach sonracha do shampla DNA CSF (AUC = 0.974) agus sampla plasma cfDNA (AUC = 0.908) a cinneadh sa staidéar seo, i measc 227 sampla, ba é 97.01% íogaireacht an tsampla CSF, ba é 95.65% an sainiúlacht, agus ba iad 82.61% agus 86.36% íogaireacht agus sainiúlacht an tsampla plasma. In anailís ar 44 sampla péireáilte de cfDNA plasma agus DNA sreabhán cheirbreasdromlaigh ó othair eitinn scamhógach (TBM), tá comhsheasmhacht ard de 90.91% (40/44) ag straitéis dhiagnóiseach an staidéir seo i cfDNA plasma agus DNA sreabhán cheirbreasdromlaigh, agus is é 95.45% (42/44) an íogaireacht. I leanaí a bhfuil eitinn scamhógach orthu, tá straitéis dhiagnóiseach an staidéir seo níos íogaire do shamplaí plasma ná torthaí braite Xpert ar shamplaí sú gastrach ó na hothair chéanna (28.57% VS 15.38%).
Fíor 2 Feidhmíocht anailíse ar mhúnla diagnóis eitinn do shamplaí daonra
Fíor 3 Torthaí diagnóiseacha samplaí péireáilte
Conclúid: Bunaíodh modh diagnóiseach hipiríogaireach le haghaidh eitinn sa staidéar seo, ar féidir leis uirlis dhiagnóiseach a sholáthar leis an íogaireacht bhrath is airde d'othair chliniciúla a bhfuil eitinn oligobacillary orthu (cultúr diúltach). D’fhéadfadh braiteadh eitinn hipiríogaireach bunaithe ar cfDNA plasma a bheith ina chineál samplach oiriúnach chun eitinn ghníomhach agus meiningíteas eitinn a dhiagnóisiú (tá samplaí plasma níos éasca a bhailiú ná sreabhán ceirbreach-dromlaigh d’othair a bhfuil amhras orthu go bhfuil eitinn inchinne orthu).
Nasc bunaidh: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? trí%3Dihub
Réamhrá gairid ar tháirgí braite eitinn sraith Macro & Micro-Test
I bhfianaise chastacht na samplaí a bhaineann le hothair eitinn agus a riachtanais éagsúla, cuireann Macro & Micro-Test sraith iomlán réiteach NGS ar fáil le haghaidh eastóscadh leachtaithe ó shamplaí sputum, tógáil agus seicheamhú leabharlainne Qualcomm, agus anailís sonraí. Clúdaíonn na táirgí diagnóis thapa othair eitinn, braiteadh friotaíochta drugaí eitinn, clóscríobh mycobacterium tuberculosis agus NTM, diagnóis hipiríogaireachta daoine eitinn baictéar-dhiúltacha agus daoine eitinn, etc.
Trealamh braite sraitheach le haghaidh eitinn agus miceabhaictéir:
Uimhir Mhíre | ainm an táirge | ábhar tástála táirgí | cineál sampla | samhail is infheidhme |
HWTS-3012 | Gníomhaire scaoilte samplach | Úsáidte i gcóireáil leachtúcháin samplaí sputum, tá uimhir thaifid den chéad scoth faighte aige, Sutong Machinery Equipment 20230047. | sputum | |
HWTS-NGS-P00021 | Trealamh braite cainníochta Qualcomm le haghaidh eitinn hipiríogaireach (modh gabhála tóireadóir) | Brath hipiríogaireachta neamh-ionrach (bithóipse leachtach) le haghaidh eitinn scamhógach agus nóidíní inchinne baictéar-dhiúltacha; Rinneadh anailís ar shamplaí daoine a bhfuil amhras fúthu go raibh miceabhaictéir eitinn nó miceabhaictéir neamh-eitinn orthu trí mheiteagéinómaíocht sheicheamhaithe ard-doimhne, agus soláthraíodh an fhaisnéis bhrath maidir le cibé an raibh miceabhaictéir eitinn nó miceabhaictéir neamh-eitinn ionfhabhtaithe agus an phríomhfhaisnéis frithsheasmhachta drugaí den chéad líne i gcás miceabhaictéir eitinn. | Fuil imeallach, sreabhán lavage alvéalach, hidreathorax agus ascites, sampla puncture fócais, sreabhán cheirbreasdromlaigh. | An dara glúin |
HWTS-NGS-T001 | Trealamh braite cineálúcháin Mycobacterium agus friotaíochta drugaí (modh seicheamhú aimpliúcháin ilphléacs) | Tástáil clóscríofa Mycobacterium, lena n-áirítear MTBC agus 187 NTM;Clúdaíonn braiteadh friotaíochta drugaí Mycobacterium tuberculosis 13 dhruga agus 16 shuíomh sócháin lárnacha de ghéinte friotaíochta drugaí. | Sputum, sreabhán lavage alvéalach, hidreathorax agus ascites, sampla puncture fócais, sreabhán cheirbreasdromlaigh. | Ardán déach dara/tríú glúin |
Buaicphointí: Trealamh braite frithsheasmhachta agus cineálúcháin Mycobacterium HWTS-NGS-T001 (modh aimpliúcháin ilphléacs)
Réamhrá táirge
Tá an táirge bunaithe ar na príomhdhrugaí céad agus dara líne a bhfuil cur síos orthu i dtreoirlínte cóireála TB an WHO, macrailídí agus aimíniglicóisídí a úsáidtear go coitianta i dtreoirlínte cóireála an NTM, agus clúdaíonn na suíomhanna friotaíochta drugaí gach grúpa amháin de shuíomhanna a bhaineann le friotaíocht drugaí i gcatalóg sócháin choimpléasc Mycobacterium tuberculosis an WHO, chomh maith le géinte friotaíochta drugaí agus suíomhanna sócháin eile a tuairiscíodh de réir imscrúdaithe agus staitisticí litríochtaí ard-scórála sa bhaile agus thar lear.
Tá sainaithint clóscríofa bunaithe ar na cineálacha NTM atá achoimrithe sna treoirlínte NTM a foilsíodh ag Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases agus ar chomhthuiscint na saineolaithe. Is féidir leis na tosaitheoirí clóscríofa atá deartha níos mó ná 190 speiceas NTM a aimpliú, a sheicheamhú agus a anótáil.
Trí theicneolaíocht aimplithe PCR ilphléacs spriocdhírithe, rinneadh géinte géinitíopála agus géinte frithsheasmhacha drugaí Mycobacterium a aimpliú le PCR ilphléacsach, agus fuarthas an teaglaim aimplicon de na géinte sprice a bhí le braith. Is féidir na táirgí aimplithe a thógáil i leabharlanna seicheamhaithe ard-tréchur den dara glúin nó den tríú glúin, agus is féidir gach ardán seicheamhaithe den dara glúin agus den tríú glúin a chur faoi réir seicheamhú ard-doimhne chun faisnéis seicheamh na ngéinte sprice a fháil. Trí chomparáid a dhéanamh leis na sócháin aitheanta atá sa bhunachar sonraí tagartha ionsuite (lena n-áirítear catalóg sócháin chasta Mycobacterium tuberculosis an WHO agus a ghaol le friotaíocht drugaí), cinneadh na sócháin a bhaineann le friotaíocht drugaí nó so-ghabhálacht drugaí frith-eitinn. In éineacht leis an tuaslagán cóireála sampla sputum féinoscailte de chuid Macro & Micro-Test, réitíodh fadhb éifeachtúlachta aimplithe aigéad núicléasaigh íseal samplaí sputum cliniciúla (deich n-uaire níos airde ná modhanna traidisiúnta), ionas gur féidir braiteadh seicheamhaithe friotaíochta drugaí a chur i bhfeidhm go díreach ar shamplaí sputum cliniciúla.
Raon braite táirgí
34géinte a bhaineann le friotaíocht drugaí18drugaí frith-eitinn agus6Braitheadh drugaí NTM, ag clúdach297suíomhanna frithsheasmhachta drugaí; Deich gcineál Mycobacterium tuberculosis agus níos mó ná190Braitheadh cineálacha NTM.
Tábla 1: Faisnéis faoi 18+6 Dhruga +190+NTM
Buntáiste táirge
Inoiriúnaitheacht chliniciúil láidir: is féidir na samplaí sputum a bhrath go díreach le gníomhaire féin-leachtaithe gan chultúr.
Tá an oibríocht turgnamhach simplí: tá an chéad bhabhta d'oibríocht aimpliúcháin simplí, agus críochnaítear tógáil na leabharlainne i 3 uair an chloig, rud a fheabhsaíonn éifeachtúlacht na hoibre.
Clóscríobh cuimsitheach agus friotaíocht drugaí: ag clúdach suíomhanna clóscríobh agus friotaíochta drugaí MTB agus NTM, arb iad na príomhphointí imní cliniciúil iad, clóscríobh cruinn agus brath friotaíochta drugaí, tacú le bogearraí anailíse neamhspleácha, agus tuarascálacha anailíse a ghiniúint le cliceáil amháin.
Comhoiriúnacht: comhoiriúnacht táirgí, ag oiriúnú do phríomhshrutha ardáin ILM agus MGI/ONT.
Sonraíocht táirge
Cód táirge | ainm an táirge | Ardán braite | sonraíochtaí |
HWTS-NGS-T001 | Trealamh braite cineálúcháin Mycobacterium agus friotaíochta drugaí (modh aimpliúcháin ilphléacs) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Am an phoist: 23 Eanáir 2024